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Chemiverse의 이용안내 입니다.

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화합물의 구조, 아이디 또는 SD파일을 바탕으로 검색하는 기능입니다.
사용자가 원하는 화합물 구조를 쉽고 빠르게 검색 할 수 있습니다.

화면구성

화면구성이미지1

1. 검색 할 데이터베이스 또는 서브셋 리스트
Chemiverse에서 제공하는 화합물 데이터베이스 및 사용자가 생성한 서브셋을 선택 할 수 있습니다.
2. 화합물 구조검색 도구
사용자가 입력한 구조를 기반으로 화합물을 검색하는 도구입니다.
2-1. 화합물 구조 그리기 도구
화합물 검색을 위해 구조를 그릴 수 있습니다.
2-2. 화합물 구조 검색 옵션
  • Substructure : 입력한 화합물 구조를 포함하고 있는 화합물을 검색합니다.
  • Exact : 입력한 화합물 구조와 동일한 화합물을 검색합니다.
  • Similarity : Chemiverse의 유사도 비교 알고리즘을 바탕으로 입력한 화합물 구조와 유사한 화합물을 검색합니다.
      유사도는 0~1의 값을 가지며 값이 커질수록 유사한 구조를 검색합니다.
3. 아이디 검색 도구
  • Chemiverse에서 제공하는 EQ Code, InChI 및 InChIKey 바탕으로 Exact 검색하는 기능입니다.
  • EQ Code : Chemiverse 자체적으로 부여한 화합물 코드입니다.
  • InChI : International Chemical Identifier의 약자로 분자정보를 표준적이고 화합물 구조로 변환이 가능하도록 암호화하고
      웹 또는 데이터베이스에서 검색이 가능하도록 디자인된 화합물의 식별자입니다.
  • InChIKey : InChI와 유사하지만 화합물 구조로 변환이 불가능한 식별자입니다.
4. sd파일 검색 도구
화합물 구조를 컴퓨터에서 이용할 수 있도록 저장하는 파일형식인 sd(또는 sdf) 파일을 바탕으로 파일에 포함된 화합물 구조를 Exact 검색하는 기능입니다.

튜토리얼1 - Substructure 검색

※ 전체 데이터베이스 선택 시, 검색시간이 매우 오래 걸릴 수 있으므로 사용하지 않는 것을 권장합니다.
Substructure 검색
  • 1. ‘데이터베이스/10K’ 를 선택합니다.
  • 2. 화합물 구조검색 도구에 아래의 구조를 입력합니다.
  • 3. 구조 검색 옵션에서 ‘Substructure’ 를 선택합니다.
  • 4. 검색을 실행합니다.
        검색버튼
  • 5. 다음과 같은 결과를 확인 할 수 있습니다.

튜토리얼2 - Exact 검색

※ 전체 데이터베이스 선택 시, 검색시간이 매우 오래 걸릴 수 있으므로 사용하지 않는 것을 권장합니다.
Exact 검색
  • 1. ‘데이터베이스/10K’ 를 선택합니다.
  • 2. 화합물 구조검색 도구에 아래의 구조를 입력합니다.
  • 3. 구조 검색 옵션에서 ‘Exact’ 를 선택합니다.
  • 4. 검색을 실행합니다.
        검색버튼
  • 5. 다음과 같은 결과를 확인 할 수 있습니다.

튜토리얼3 - Similarity 검색

※ 전체 데이터베이스 선택 시, 검색시간이 매우 오래 걸릴 수 있으므로 사용하지 않는 것을 권장합니다.
Similarity 검색
  • 1. ‘데이터베이스/10K’ 를 선택합니다.
  • 2. 화합물 구조검색 도구에 아래의 구조를 입력합니다.
  • 3. 구조 검색 옵션에서 ‘Similarity’ 를 선택하고, 우측에 score에 ‘0.7’을
        입력합니다. Score는 0~1사이의 값을 가지며 1에 가까울수록 유사한
        구조를 검색합니다.
  • 4. 검색을 실행합니다.
        검색버튼
  • 5. 다음과 같은 결과를 확인 할 수 있습니다.

튜토리얼4 - 아이디 검색

※ 전체 데이터베이스 선택 시, 검색시간이 매우 오래 걸릴 수 있으므로 사용하지 않는 것을 권장합니다.
아이디 검색
  • 1. ‘데이터베이스/10K’ 를 선택합니다.
  • 2. 아이디 검색 도구에 아래와 같이 입력합니다.

    EQ code 선택 시, 3141
    InChI 선택 시, InChI=1S/C23H25FN2O3S2/c24-20-7-6-18-12-19
    (15-25-14-17-8-11-31(27,28)16-17)23(26-22(18)13-20)
    29-9-10-30-21-4-2-1-3-5-21/h1-7,12-13,17,25H,8-11,14-
    16H2/p+1/t17-/m1/s1
    InChIKey 선택 시, YNJNLORIFQFZIX-QGZVFWFLSA-O

  • 3. 검색을 실행합니다.
        검색버튼
  • 4. EQ코드, InChI 아이디, InChIKey 아이디 모두 같은 결과를
        확인 할 수 있습니다.

튜토리얼5 - sd파일 검색

※ 전체 데이터베이스 선택 시, 검색시간이 매우 오래 걸릴 수 있으므로 사용하지 않는 것을 권장합니다.
sd파일 검색
  • 1. ‘데이터베이스/10K’ 를 선택합니다.
  • 2. ‘파일 선택’ 을 선택하고, 파일 선택 창이 열리면 원하는
        sd파일을 선택합니다. (샘플 다운로드)
  • 3. 검색을 실행합니다.
        검색버튼
  • 4. 다음과 같은 결과를 확인 할 수 있습니다.